勤怠管理システムの使いにくさや集計の手間に悩み、乗り換えを検討していませんか?
SaaS比較サイトの「BOXIL」は、勤怠管理システムの乗り換えに携わった438人を対象に、「勤怠管理システムの乗り換え実態調査」を実施しました。本記事では調査にもとづいて、乗り換え先ランキングや企業規模別の選定の決め手、マネーフォワードやジョブカンなどを徹底分析。
他社のリアルなデータを参考に、失敗しない製品選びにお役立てください。
本データに関する概要や引用方法は ▶調査概要 を参照ください。なお、以下で用いる「企業規模」は、アカウントをもつ従業員数で区分しています。小規模企業は49人以下、中小企業は50〜299人、中堅企業は300〜999人、大企業は1,000人以上です。
勤怠管理システムを比較する際の選び方やおすすめ製品はこちらの記事で紹介しています。
勤怠管理システムを乗り換えるに至った課題 TOPは従業員の操作性
勤怠管理システムを乗り換た理由を尋ねたところ、1番の理由は「従業員の操作性向上」で30.1%でした。

毎日打刻作業を行う従業員にとって、画面の見づらさや操作の複雑さは大きなストレスになります。このストレスが打刻漏れや申請ミスを招き、結果として管理部門の修正作業の増加につながるケースが多いと考えられます。
また、すでにシステムを導入済みの企業でありながら、「デジタル化・ペーパーレス化の推進(DX)」(29.2%)、「集計・設定作業の効率化」(28.8%)といった理由が上位に挙げられていました。これは、紙やExcelでの管理がいまだに残っていたり、集計作業に手戻りが発生したりと、システム導入による効率化が十分でない現実が浮き彫りになった結果と言えます。
【企業規模別】勤怠管理の課題
直面している勤怠管理の課題は、企業規模によっても大きく異なります。
| 大企業(1,000人以上) | 中堅企業(300〜999人) | 中小企業(50〜299人) | 小規模企業(49人以下) | |
|---|---|---|---|---|
| 従業員の操作性向上 | 1位 | 1位 | 5位 | 4位 |
| デジタル化・ペーパーレス化の推進(DX) | 2位 | 4位 | 5位 | 1位 |
| 集計・設定作業の効率化 | 5位 | 4位 | 2位 | 2位 |
| コストの見直し | 4位 | 4位 | 3位 | 2位 |
| テレワークや複雑なシフト管理への対応 | 3位 | 10位 | 1位 | 9位 |
| システム連携の強化 | 8位 | 2位 | 5位 | 6位 |
| 管理者の操作性向上 | 7位 | 2位 | 8位 | 8位 |
| システム動作の安定性を確保 | 6位 | 7位 | 9位 | 6位 |
| 法改正へのよりスムーズな対応 | 10位 | 7位 | 11位 | 10位 |
| 打刻方法の見直し | 9位 | 10位 | 12位 | 4位 |
| サポート体制の見直し | 11位 | 9位 | 10位 | 10位 |
| 以前のサービスの提供終了・プラン改定 | 12位 | 10位 | 3位 | 12位 |
大企業(1,000人以上)および中堅企業(300〜999人)では、「従業員の操作性向上」「従業員の操作性向上」が共通して最大の課題です。利用人数の多さから、わずかな使いにくさでも全体の業務効率を大きく下げてしまうため、現場が迷わないことが重視されています。
中小企業(50〜299人)においては、「テレワークや複雑なシフト管理への対応」が最も大きな課題です。働き方が多様化したことで、従来のシンプルな打刻方法だけでは対応しきれず、柔軟な就業ルールにマッチするシステムが求められています。
小規模企業(49人以下)では、「デジタル化・ペーパーレス化の推進(DX)」が最大の課題です。紙のタイムカードやExcel管理からの脱却を目指し、勤怠管理システムへ移行する検討が進んでいます。
勤怠管理システムの乗り換え先人気ランキング 1位は「マネーフォワード クラウド勤怠」
乗り換えた後に利用している勤怠管理システムを尋ねたところ、「マネーフォワード クラウド勤怠」(20.5%)が最多でした。

続いて「ジョブカン勤怠管理」(13.5%)のシェアも高く、両社が市場を牽引しています。どちらも導入しやすく、他システムとの連携に強みがあり、乗り換えを検討する企業のニーズに合ったサービスであると言えます。
- 1位 マネーフォワード クラウド勤怠(20.5%)
- 2位 ジョブカン勤怠管理(13.5%)
- 3位 freee(8.7%)
- 4位 ジンジャー勤怠(7.5%)
- 4位 HRMOS勤怠(7.5%)
- 6位 自社開発のシステム(7.1%)
- 7位 楽楽勤怠(6.8%)
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新規導入と乗り換えを合算した場合の人気ランキングも、上記とおおよそ同じです。細かな違いは次のとおりです。
- ジョブカン勤怠管理が17.3%のシェアで、マネーフォワード クラウド勤怠の18.6%に迫る
- ジンジャー勤怠が9.1%で3位
- 6位にはKING OF TIMEが6.1%でランクイン
勤怠管理システムの全体シェアをチェックしたい方には下記の記事がおすすめです。企業規模別のシェアランキングも紹介しています。
【企業規模別】乗り換え先として人気なサービス
企業規模ごとに見ると、組織が大きくなるにつれて乗り換え先のサービスも多様化していることがわかります。

大企業では「freee」と「自社開発のシステム」、中堅企業では「楽楽勤怠」を導入する傾向が見られます。freeeや楽楽勤怠は、システムの安定性やセキュリティ基準を重視する企業が選んでいると考えられます。
また、大企業で自社開発システムが根強く使われている背景には、パッケージ製品では対応しきれない複雑な勤務体系や独自ルールを持つ企業が、自社に最適化されたシステムを求めていると推測されます。
一方、従業員数が少ない小規模企業や中小企業では、「マネーフォワード クラウド勤怠」と「ジョブカン勤怠管理」が、導入の手軽さやコスト面で人気を集めています。
【導入前のサービス別】人気のある乗り換え先のシステム
もともと利用していたシステムによって、移行先のシステムにも違いが見られます。
ジョブカン勤怠管理、マネーフォワード クラウド勤怠、freeeの間では、ユーザー同士が相互に乗り換える傾向が見受けられます。どのサービスもシリーズ展開が充実し、低コストでの導入が可能ですが、それぞれに異なる特徴を求めて乗り換えていると考えられます。
また、自社開発システムからも再び自社開発を選ぶケースが最も多く、外部サービスへ移行する場合もCOMPANY勤怠管理、アマノ、楽楽勤怠、freeeといった、大企業向けのサービスが人気です。
ジンジャー勤怠は全体でシェア4位ですが、乗り換え先のランキングにはほとんど登場していません。これは、ジンジャー勤怠が多様なサービスから広く導入されていることを示しており、さまざまな企業にフィットしやすいサービスであることがうかがえます。
奉行シリーズからの主な乗り換え先
- マネーフォワード クラウド勤怠 (29.8%)
- ジョブカン勤怠管理 (19.1%)
- 楽楽勤怠 (17.0%)
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ジョブカン勤怠管理からの主な乗り換え先
- マネーフォワード クラウド勤怠 (40.0%)
- freee (30.0%)
- ジンジャー勤怠 (10.0%)
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マネーフォワード クラウド勤怠からの主な乗り換え先
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自社開発システムからの主な乗り換え先
- 自社開発のシステム (31.7%)
- COMPANY勤怠管理 (9.8%)
- アマノ (9.8%)
- 楽楽勤怠 (9.8%)
- freee (9.8%)
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勤怠管理システムを選定するに至った決め手 1番はコスト
現在利用している勤怠管理システムを選んだ決め手について尋ねたところ、「コストが妥当・割安である」が32.6%で最多でした。後には、「システム動作の安定性」(28.8%)や「従業員にとっての操作性」(27.9%)が続いています。

さらに「スムーズなシステム連携」や「導入支援やサポートの手厚さ」など、合計10項目において20%以上の人が「決め手になった」と回答しました。このことから、多くの企業がコストだけに注目するのではなく、さまざまな要素を総合的に評価して選定している現状がわかります。
コストの低さだけで選ぶと、システムの安定性が不十分だったり、現場で使われなくなってしまうこともあります。勤怠管理システムの導入では、コストと品質の両立が大切です。
【関連記事】
【企業規模別】システム選定の決め手:フェーズによって決め手が異なる
企業規模別で見た場合においても、「コストが妥当・割安である」は最も多くの方が決め手だと回答していました。ただし、2位以下の基準には違いが見られます。
| 大企業(1,000人以上) | 中堅企業(300〜999人) | 中小企業(50〜299人) | 小規模企業(49人以下) | |
|---|---|---|---|---|
| コストが妥当・割安である | 1位 | 1位 | 1位 | 1位 |
| システム動作の安定性 | 5位 | 2位 | 2位 | 3位 |
| 従業員にとっての操作性 | 2位 | 7位 | 3位 | 2位 |
| スムーズなシステム連携 | 3位 | 9位 | 4位 | 3位 |
| 導入支援やサポートの手厚さ | 3位 | 7位 | 5位 | 9位 |
| 管理者にとっての操作性 | 6位 | 5位 | 9位 | 5位 |
| セキュリティ基準や認証 | 6位 | 3位 | 15位 | 7位 |
| 集計・設定作業の効率化 | 10位 | 5位 | 10位 | 9位 |
| 導入実績や市場シェア | 8位 | 3位 | 12位 | 12位 |
| 自社の就業規則や働き方に適合 | 9位 | 14位 | 6位 | 14位 |
| 打刻方法への対応 | 12位 | 12位 | 6位 | 5位 |
| 法改正へのスムーズな対応 | 11位 | 10位 | 12位 | 7位 |
| 無料トライアル等での事前の操作確認 | 15位 | 14位 | 6位 | 9位 |
| 営業担当者の提案力・課題解決への姿勢 | 14位 | 10位 | 11位 | 12位 |
| 知人や他社の評判・口コミ | 13位 | 12位 | 14位 | 14位 |
大企業では「スムーズなシステム連携」や「導入支援やサポートの手厚さ」が上位に入っています。雇用形態や就業規則が複雑になると、システム同士の連携やベンダーサポートの充実度が決め手となる場面が増えているようです。
小規模企業や中小企業では「システム動作の安定性」と「従業員にとっての操作性」に重点を置いて選定しています。中堅・大企業と比べると制約が緩やかなため、確実に運用できることが重視されていると考えられます。
勤怠管理システムの各製品が選ばれる理由
乗り換え時に各社の勤怠管理システムが選ばれた理由をもとに、導入をおすすめする企業をまとめました。
| サービス名 | こんな企業におすすめ |
|---|---|
| マネーフォワード クラウド勤怠 | バックオフィス全体を効率化したい企業 |
| ジョブカン勤怠管理 | 現場への定着を最優先したい企業 |
| freee | コストを抑えつつ、上場準備レベルのセキュリティと安定性を求める企業 |
| ジンジャー勤怠 | 操作性・コスト・連携性に加え、人事データの一元管理を重視したい企業 |
| HRMOS勤怠 | 従業員の使いやすさと高いセキュリティ基準を重視する企業 |
| 楽楽勤怠 | 高い安定性のもとでシステム運用したい企業 |
| 自社開発のシステム | 独自の複雑な就業規則や運用ルールがある企業 |
マネーフォワード クラウド勤怠
マネーフォワード クラウド勤怠は、「システム動作の安定性」と「スムーズなシステム連携」が高く評価されています。勤怠管理だけでなく、給与計算や経費精算など、シリーズ製品とのシームレスな連携によるバックオフィス全体の最適化を目指す企業に選ばれています。
マネーフォワード クラウド勤怠を選んだ理由TOP3
マネーフォワード クラウド勤怠を乗り換え先に選んだ企業が、選定時の決め手だと回答とその割合は次のとおりです。
- システム動作の安定性(36.7%、90人中33人回答)
- スムーズなシステム連携(31.1%、90人中28人回答)
- コストが妥当・割安である(27.8%、90人中25人回答)
【関連記事】
>【マネーフォワード クラウド勤怠 導入事例】会計・経費との「連動性」が最終的な決め手に
>【マネーフォワード クラウド勤怠 導入事例】データが自動抽出され、Excelにインポートできる点を評価
データの連携も容易で便利だと思います。
タイトルにも記載しましたが、出勤・退勤の打刻はとてもわかりやすく、
スマートフォンから打刻した場合に打刻場所がわかるGPS打刻の機能も従業員管理面から有用かと思います。
ジョブカン勤怠管理
ジョブカン勤怠管理は、「管理者・従業員にとっての操作性」と「導入支援やサポートの手厚さ」が選定の大きな決め手となっています。現場の誰もが迷わず使える画面のわかりやすさと、充実したサポート体制により、初めてシステムを導入する企業やスムーズな定着を重視する企業に適しています。
ジョブカン勤怠管理を選んだ理由TOP3
- 従業員にとっての操作性(35.6%、59人中21人回答)
- 管理者にとっての操作性(35.6%、59人中21人回答)
- 導入支援やサポートの手厚さ(32.2%、59人中19人回答)
【関連記事】
>【ジョブカン勤怠管理 導入事例】決め手は「直感的な見やすさ」
特にモバイル対応が優れており、リモートワークや外出先からの打刻も簡単にできる点が高評価の理由です。
また、他のシステムと比較してコストパフォーマンスが良く、中小企業にも導入しやすい価格設定となっている点が嬉しいポイントです。
freee
freeeは、「コストが妥当・割安である」と「システム動作の安定性」が半数の企業から支持されています。加えて「セキュリティ基準」や「サポートの手厚さ」も高く評価されています。コストパフォーマンスと上場レベルの堅牢な管理体制を求める企業に選ばれているサービスです。
freeeを選んだ理由TOP5
- コストが妥当・割安である(50.0%、38人中19人回答)
- システム動作の安定性(50.0%、38人中19人回答)
- 導入支援やサポートの手厚さ(36.8%、38人中14人回答)
- 集計・設定作業の効率化(36.8%、38人中14人回答)
- セキュリティ基準や認証(36.8%、38人中14人回答)
【関連記事】
>【freee勤怠管理plus 導入事例】最も効率化された業務は「打刻ミスの確認がなくなったこと」
ジンジャー勤怠
ジンジャー勤怠は、「コストが妥当・割安である」に加え、システム連携、操作性、作業効率化が同率で並び、総合的なバランスの良さが高く評価されています。人事データを一元管理できる強みを活かし、コストを抑えながらも、バックオフィス全体の業務効率と使いやすさを同時に実現したい企業に適しています。
ジンジャー勤怠を選んだ理由TOP4
- コストが妥当・割安である(24.2%、33人中8人回答)
- 集計・設定作業の効率化(24.2%、33人中8人回答)
- スムーズなシステム連携(24.2%、33人中8人回答)
- 従業員にとっての操作性(24.2%、33人中8人回答)
HRMOS勤怠
HRMOS勤怠は、「従業員にとっての操作性」「セキュリティ基準や導入実績」「導入実績や市場シェア」が同率で重視されています。日々の使いやすさはもちろんのこと、ISMSをはじめとしたセキュリティ体制や市場での信頼性を重視する企業、また将来的なタレントマネジメント連携を見据える企業に支持されています。
HRMOS勤怠を選んだ理由TOP3
- 従業員にとっての操作性(27.3%、33人中9人回答)
- セキュリティ基準や認証(27.3%、33人中9人回答)
- 導入実績や市場シェア(27.3%、33人中9人回答)
【関連記事】
>【HRMOS勤怠 導入事例】一人当たりの料金を抑えられた
>【HRMOS勤怠 導入事例】社労士の推奨で導入を決意
基本的には「打刻するだけ」のシンプルな仕様であり、操作も簡単で非常に使いやすく感じました。
楽楽勤怠
楽楽勤怠は、「コストが妥当・割安である」と「従業員にとっての操作性」が半数以上の企業から決め手として挙げられています。管理者側の操作性やシステムの安定性も高く評価されており、システム導入における失敗のリスクを最小限に抑えたい企業に人気があります。
楽楽勤怠を選んだ理由TOP5
- コストが妥当・割安である(53.3%、30人中16人回答)
- 従業員にとっての操作性(50.0%、30人中15人回答)
- システム動作の安定性(40.0%、30人中12人回答)
- 管理者にとっての操作性(40.0%、30人中12人回答)
- 導入実績や市場シェア(40.0%、30人中12人回答)
自社開発のシステム
自社開発のシステムを選ぶ企業では、「システム動作の安定性」と「管理者にとっての操作性」が主な決め手です。パッケージ製品では対応しきれない独自の複雑な就業規則や管理要件に対し、自社に完全に最適化された使い勝手と、安定した運用環境を求める企業に選ばれ続けています。
自社開発のシステムを選んだ理由TOP3
- システム動作の安定性(35.5%、31人中11人回答)
- コストが妥当・割安である(32.3%、31人中10人回答)
- 管理者にとっての操作性(32.3%、31人中10人回答)
勤怠管理システムの比較ならBOXIL
勤怠管理システムの導入や乗り換えを検討する際は、コストだけを重視するのではなく、想定した運用が実現できるかどうかを必ず確認しましょう。自社の要件を整理し、複数のサービスを比較検討することが重要です。
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調査概要
タイトル:勤怠管理システムの乗り換え実態調査
調査方法:インターネット調査
調査地域:全国
調査対象:勤怠管理システムの乗り換えに携わった438人
調査期間:2025年12月11日〜18日
調査主体:スマートキャンプ株式会社
※本アンケート結果は小数点以下任意の桁を四捨五入しています。合計が100%にならない場合があります。
※企業規模の区分は、勤怠管理システムのアカウントが付与されている一般従業員の数で行っています。小規模企業は49人以下、中小企業は50〜299人、中堅企業は300〜999人、大企業は1,000人以上です。
※サービス名の一部は、アンケート時の選択肢から名称を調整しています。「freee(freee勤怠管理Plus / freee人事労務など)」を「freee」、「アマノ(TimePro / TimeP@CK / CYBER XEEDなど)」を「アマノ」として本文では表記しています。
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記載例:BOXIL「経費精算システムの費用調査」, 2025年11月XX日確認, https://boxil.jp/mag/a10448/
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